Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms