Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNK2Q07912 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms