Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC9Q06265 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms