Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7AQ04656 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7AQ04656 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms