Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms