Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ID3Q02535 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ID3Q02535 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ID3Q02535 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ID3Q02535 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ID3Q02535 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ID3Q02535 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ID3Q02535 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ID3Q02535 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ID3Q02535 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ID3Q02535 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ID3Q02535 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ID3Q02535 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ID3Q02535 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ID3Q02535 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ID3Q02535 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms