Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms