Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHODHQ02127 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHODHQ02127 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms