Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTBN1Q01082 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms