Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEX3Q00994 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms