Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP1Q00587 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms