Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRB1P82279 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CRB1P82279 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRB1P82279 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CRB1P82279 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CRB1P82279 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRB1P82279 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRB1P82279 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRB1P82279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CRB1P82279 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CRB1P82279 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CRB1P82279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRB1P82279 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRB1P82279 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms