Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms