Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM193AP78312 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms