Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms