Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RACK1P63244 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RACK1P63244 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RACK1P63244 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RACK1P63244 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms