Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL38P63173 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL38P63173 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL38P63173 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL38P63173 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL38P63173 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL38P63173 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL38P63173 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL38P63173 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL38P63173 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL38P63173 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL38P63173 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms