Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms