Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3P61158 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACTR3P61158 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3P61158 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3P61158 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3P61158 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms