Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVPABLB-1P60509 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms