Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00315P59091 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms