Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP4P57796 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP4P57796 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP4P57796 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP4P57796 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP4P57796 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP4P57796 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP4P57796 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP4P57796 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP4P57796 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CABP4P57796 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CABP4P57796 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms