Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms