Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms