Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms