Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms