Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC13P55735 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC13P55735 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC13P55735 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC13P55735 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC13P55735 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms