Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TERF1P54274 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TERF1P54274 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TERF1P54274 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TERF1P54274 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TERF1P54274 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TERF1P54274 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TERF1P54274 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TERF1P54274 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TERF1P54274 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TERF1P54274 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TERF1P54274 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TERF1P54274 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TERF1P54274 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TERF1P54274 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TERF1P54274 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TERF1P54274 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TERF1P54274 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TERF1P54274 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TERF1P54274 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TERF1P54274 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TERF1P54274 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TERF1P54274 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TERF1P54274 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TERF1P54274 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TERF1P54274 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TERF1P54274 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms