Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYBA4P53673 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms