Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUBP1P53384 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms