Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms