Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX1P52954 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX1P52954 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX1P52954 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX1P52954 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX1P52954 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX1P52954 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX1P52954 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX1P52954 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX1P52954 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX1P52954 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX1P52954 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX1P52954 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms