Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF143P52747 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF143P52747 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms