Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDR1P51861 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR1P51861 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR1P51861 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR1P51861 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR1P51861 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDR1P51861 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDR1P51861 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR1P51861 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR1P51861 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR1P51861 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR1P51861 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR1P51861 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms