Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1GP51170 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms