Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRE11P49959 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRE11P49959 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
MRE11P49959 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MRE11P49959 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRE11P49959 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms