Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFBP49765 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms