Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRIM1P49642 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms