Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTPAP49638 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTPAP49638 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTPAP49638 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTPAP49638 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTPAP49638 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTPAP49638 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTPAP49638 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTPAP49638 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTPAP49638 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTPAP49638 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTPAP49638 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTPAP49638 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTPAP49638 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTPAP49638 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTPAP49638 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTPAP49638 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTPAP49638 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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