Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC1P48995 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC1P48995 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC1P48995 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC1P48995 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC1P48995 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms