Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX5P48382 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX5P48382 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX5P48382 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX5P48382 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX5P48382 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX5P48382 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX5P48382 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX5P48382 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX5P48382 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX5P48382 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX5P48382 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX5P48382 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX5P48382 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX5P48382 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX5P48382 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX5P48382 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX5P48382 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX5P48382 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX5P48382 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX5P48382 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX5P48382 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX5P48382 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX5P48382 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX5P48382 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX5P48382 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RFX5P48382 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX5P48382 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX5P48382 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX5P48382 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFX5P48382 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms