Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP2K4P45985 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms