Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA4P43681 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms