Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD2P43304 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD2P43304 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD2P43304 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD2P43304 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD2P43304 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD2P43304 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPD2P43304 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPD2P43304 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD2P43304 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD2P43304 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPD2P43304 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPD2P43304 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPD2P43304 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPD2P43304 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPD2P43304 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPD2P43304 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPD2P43304 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPD2P43304 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPD2P43304 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPD2P43304 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms