Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSKP43235 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSKP43235 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSKP43235 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSKP43235 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSKP43235 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSKP43235 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSKP43235 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms