Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTHFRP42898 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms