Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTTP42858 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTTP42858 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTTP42858 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTTP42858 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTTP42858 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTTP42858 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HTTP42858 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTTP42858 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTTP42858 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTTP42858 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTTP42858 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTTP42858 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTTP42858 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms