Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP8P40818 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP8P40818 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP8P40818 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP8P40818 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP8P40818 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP8P40818 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP8P40818 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP8P40818 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP8P40818 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP8P40818 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP8P40818 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP8P40818 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP8P40818 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP8P40818 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP8P40818 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP8P40818 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP8P40818 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP8P40818 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP8P40818 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP8P40818 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP8P40818 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP8P40818 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP8P40818 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms