Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms