Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP62P37198 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP62P37198 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP62P37198 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP62P37198 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP62P37198 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP62P37198 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP62P37198 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP62P37198 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP62P37198 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP62P37198 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP62P37198 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP62P37198 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP62P37198 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP62P37198 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP62P37198 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP62P37198 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP62P37198 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP62P37198 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms